广西大学开了个发布会,介绍他们在甘蔗生物育种ai 方面的大进展。

2月6日,广西大学开了个发布会,介绍他们在甘蔗生物育种AI方面的大进展。这个消息是中国教育报传出来的。广西大学农学院、广西甘蔗生物育种实验室还有亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,一起在甘蔗基础研究、新品种选育和AI大模型这几方面搞了不少名堂。重点就是那篇文章《多尺度泛基因组图谱赋能混合倍性甘蔗物种的基因组解析》,他们就当天在《Science》杂志上发了。这事儿里,广西大学农学院、广西甘蔗生物育种实验室还有亚热带国重室是第一通讯单位和共同第一作者单位,福建农林大学也是共同第一作者单位和通讯单位。领头的是广西大学的张积森教授和福建农林大学的唐海宝教授,另外还有黄育敏博士、张以星还有张清教授一起合作。这就意味着是第一次有广西本地单位作为第一通讯单位在《Science》上发文了。张积森教授还给大家讲了讲他们研究的概况。甘蔗这东西可是全球重要的经济作物呢,能拿来制糖、酿酒还有搞生物能源。现在种的甘蔗是好多年前高糖的热带种和高抗逆的野生种杂交出来的。不过问题来了,这甘蔗的基因组太复杂了,倍性高、染色体多、变异频繁、重复序列还多。以前那种单一参考基因组根本搞不定它的遗传结构和等位剂量信息。研究发现传统的办法不行了,得有个新的分析体系才行。所以研究团队就搞了个图泛基因组分析体系,整合了4个种的9套基因组。这一弄就把约82%的遗传多样性给抓住了,比以前那个单一参考基因组才34%好多了。这不光是覆盖范围变广了,还让跨种群、跨倍性的分析有了统一框架。他们还提出了个DosageGWAS方法,比以前那些线性方法强多了。用这个方法找到了很多跟糖分、叶夹角有关的基因,还把糖分代谢这些重要性状的遗传基础给解析清楚了。比较高粱族发现甘蔗跟高粱在碳水化合物代谢和激素响应上挺像的。用CRISPR功能验证发现TB1是控制分蘖的关键基因。敲除这个基因的植株长得特别茂盛,产量也高。最后他们还把一个甘蔗智能育种大模型“西智蔗”(GXU-SmartCane)给发布了出来。这个模型能帮忙做育种决策和田间管理啥的。这对甘蔗产业数字化升级来说可是大助力啊。