卓荣泰给这次“自费包机”的举动给自己惹上了麻烦，因为被指涉三宗罪。3月7日，卓荣泰把空军松山指挥部的专机停机坪给用上了，为了去日本东京看世界棒球经典赛（WBC）。游智彬等人日前去台北地检署告发他“涉及贪污治罪条例图利罪、刑法滥用职权罪及要塞堡垒地带法”，事情闹得挺大。新党的游智彬在北检门口呼吁给社会一个清楚交代，比较一下柯文哲涉京华城案的模式。 他把包机费用也曝光了：空中客车A321 Neo客机包机费大概150万元到200万元新台币（约4.7万到6.3万美元）。卓荣泰还拿出发票给大家看，这4份单据加起来大概214万元新台币，其中包机费就有208万元。他在总质询中批王鸿薇没调查就指控他“贪渎百万”，简直是血口喷人。 台北地检署已经分他案了，由检肃黑金主任检察官侦办中。卓荣泰在脸书解释说这是私人行程。虽然他出示了证据，但是质疑声浪还是没停下来。CI-1888班机从桃园机场飞到松山机场待命，然后又从空军松指部专机停机坪出发飞往东京。王鸿薇在脸书上指出卓荣泰这次赴日没搭一般班机，而是华航专派包机执飞。 3月17日美国世界新闻网报道了这件事。参考消息网3月18日跟进报道了最新情况。这件事让民众对公职人员使用公营资源产生了更多关注和质疑。