1966年，北京市卫戍区从正军级变为正兵团级。傅崇碧接任司令员，谢富治是军区第一政委，也是卫戍区第一政委。此外，谢富治还是北京市委第一书记兼第二政委，黄作珍则是第三政委。当时的黄作珍实际上主持日常的政治工作，前两位并没有过多参与。傅崇碧之所以提名黄作珍当卫戍区政委，是因为他能完全掌控黄作珍的工作安排。黄作珍在特殊时期发挥了重要作用，不仅在政治工作上表现出色，还在维护首都安定方面立下了功劳。 1967年，大规模运动逐渐深入，部队开始介入地方工作。各省市纷纷成立了革委会，作为首都的北京也不例外。谢富治被任命为革委会主任，吴德、郑维山、傅崇碧等人则担任副主任。在这次革委会成立的过程中，谢富治曾提出让卫戍区第三政委兼任秘书长的提议，然而这个提议却遭到了傅崇碧的坚决拒绝。 到了1971年，北京市卫戍区隶属于北京军区，不过它的业务管理是由总参谋部负责的。实际上，卫戍区直接受中央首长指挥。那时候军队干部兼任地方职务已经很普遍。随着文革结束，军队干部逐渐从地方工作中撤出，专心从事军队建设。这标志着一个时代结束了。 傅崇碧曾试图让卫戍区政委当秘书长，但是他坚决不同意这个提议。1967年大规模运动期间，北京也成立了自己的革委会，谢富治被任命为主任。吴德、郑维山、傅崇碧等人担任副主任。在讨论如何开展工作时，谢富治提出了让卫戍区第三政委兼任秘书长的建议，但遭到了傅崇碧的坚决拒绝。 北京卫戍区的组织与指挥结构非常特殊。它不仅有着重要的政治任务，还要承担维护首都安定的重任。傅崇碧提名黄作珍当卫戍区政委，所以他能掌握黄作珍的工作安排。随着1971年北京市委恢复和军队干部逐渐从地方撤出这个过程，军队与地方的界限变得更加明确。