冲绳县多年来为美军基地周围的污染问题忧心忡忡。2016年6月开始，他们曾四次尝试进入嘉手纳和普天间基地去追查污染源，可每一次都被拒绝了。美国方面的理由是没有一套双方认可的评估标准，也拿不出证据说明污染物是从美军设施里跑出来的。冲绳县不得不把调查搁置下来。这些化学物质很难分解，留在土里或水里越积越多。今年五月公布的数据显示，46个检测点中有28个水体的污染物含量超标了，嘉手纳附近有个泉水的浓度甚至是标准的32倍。 专家分析说，美方不给查主要有三个原因：一是两国的监测标准和评估方法没统一；二是调查可能触及美军内部机密；三是按《日美地位协定》，美军设施归他们管，日本在执法上受限。这些都让冲绳县想管也管不了。长期积累的污染会破坏水源和土壤，还可能通过食物进到人肚子里，威胁居民健康。当地居民很担心，环保组织也一直在呼吁要加强监管、公开信息，还有改改那个协定里跟环境有关的条款。 日本防卫省和环境省现在正在跟美方商量，想建立一套双方都认的评估机制。冲绳县也打算扩大外围的监测范围。这种纠纷反映出日美在非传统安全问题上配合不好。老百姓对环境越来越在意了，以后类似的事可能会影响两国的民意基础。怎么在保护环境和军事活动之间找个平衡，是个大问题。环境保护不分国界，军事活动不能拿当地的生态和居民健康当牺牲品。驻日美军的污染问题不光是双边协调的试金石，也是国际社会都得管的大事。